Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB4Q9NTQ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms