Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms