Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms