Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms