Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms