Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms