Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms