Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms