Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSU72Q9NP77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms