Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms