Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3FQ9H1D9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3FQ9H1D9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms