Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms