Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NYXQ9GZU5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms