Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms