Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms