Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3Q9BY71 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3Q9BY71 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3Q9BY71 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3Q9BY71 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3Q9BY71 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms