Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms