Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS1Q99742 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms