Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms