Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD6Q96NK8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms