Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms