Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms