Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms