Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP47Q96K76 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms