Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms