Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF1Q92879 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF1Q92879 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF1Q92879 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF1Q92879 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF1Q92879 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF1Q92879 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms