Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG1Q8WVM7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms