Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHDC4Q8TBB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms