Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms