Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms