Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms