Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms