Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFRP1Q8N474 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms