Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms