Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC6Q7Z403 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms