Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms