Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms