Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP6Q6ZN66 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms