Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms