Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPPQ6IPU0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPPQ6IPU0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms