Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPH2Q6IBW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms