Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3L3Q68CJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms