Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM29Q5VYK3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms