Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms