Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms