Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC4Q5GLZ8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC4Q5GLZ8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms