Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms