Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms