Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA9Q16790 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA9Q16790 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA9Q16790 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA9Q16790 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CA9Q16790 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CA9Q16790 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CA9Q16790 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA9Q16790 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA9Q16790 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA9Q16790 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA9Q16790 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CA9Q16790 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA9Q16790 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA9Q16790 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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