Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYPL1Q16563 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SYPL1Q16563 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYPL1Q16563 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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